MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449

Total Repeats: 103098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009348	GGC	2	6	129	134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009348	GCA	2	6	218	223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297125
3	NC_009348	CAT	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297125
4	NC_009348	TGC	2	6	482	487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297125
5	NC_009348	AGA	2	6	505	510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297125
6	NC_009348	TCG	2	6	589	594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297125
7	NC_009348	GGC	2	6	681	686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297125
8	NC_009348	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297125
9	NC_009348	AAG	2	6	744	749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297125
10	NC_009348	TTA	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145297125
11	NC_009348	TTC	2	6	882	887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145297125
12	NC_009348	CAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297125
13	NC_009348	AGG	2	6	907	912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145297125
14	NC_009348	TTC	2	6	915	920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145297125
15	NC_009348	GCT	2	6	935	940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297125
16	NC_009348	CAG	2	6	951	956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297125
17	NC_009348	ATC	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297125
18	NC_009348	GCC	2	6	1052	1057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297125
19	NC_009348	CTT	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145297125
20	NC_009348	CGCCAA	2	12	1199	1210	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145297125
21	NC_009348	ACA	2	6	1297	1302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297125
22	NC_009348	AGA	2	6	1306	1311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297125
23	NC_009348	CTG	2	6	1347	1352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297125
24	NC_009348	ACCA	2	8	1419	1426	50 %	0 %	0 %	50 %	145297125
25	NC_009348	TGG	2	6	1454	1459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297125
26	NC_009348	AC	3	6	1466	1471	50 %	0 %	0 %	50 %	145297125
27	NC_009348	TTC	2	6	1477	1482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145297125
28	NC_009348	TGCC	2	8	1484	1491	0 %	25 %	25 %	50 %	145297125
29	NC_009348	AGC	2	6	1501	1506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297125
30	NC_009348	AGG	2	6	1510	1515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145297125
31	NC_009348	AGG	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145297125
32	NC_009348	CT	3	6	1560	1565	0 %	50 %	0 %	50 %	145297125
33	NC_009348	AAC	2	6	1637	1642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009348	GGCC	2	8	1720	1727	0 %	0 %	50 %	50 %	145297126
35	NC_009348	CTG	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297126
36	NC_009348	GAT	2	6	1809	1814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297126
37	NC_009348	AGGTC	2	10	1815	1824	20 %	20 %	40 %	20 %	145297126
38	NC_009348	AAT	2	6	1831	1836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145297126
39	NC_009348	CAC	2	6	1854	1859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297126
40	NC_009348	GC	3	6	1867	1872	0 %	0 %	50 %	50 %	145297126
41	NC_009348	GCT	2	6	1875	1880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297126
42	NC_009348	ATC	2	6	1945	1950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297126
43	NC_009348	CTGC	2	8	1984	1991	0 %	25 %	25 %	50 %	145297126
44	NC_009348	GAA	2	6	2058	2063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297126
45	NC_009348	TAC	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297126
46	NC_009348	CGAC	2	8	2165	2172	25 %	0 %	25 %	50 %	145297126
47	NC_009348	GTC	2	6	2192	2197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297126
48	NC_009348	GAA	2	6	2209	2214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297126
49	NC_009348	ATC	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297126
50	NC_009348	GCA	2	6	2315	2320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297126
51	NC_009348	GC	3	6	2325	2330	0 %	0 %	50 %	50 %	145297126
52	NC_009348	TGG	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297126
53	NC_009348	CGC	2	6	2463	2468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297126
54	NC_009348	CTG	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297126
55	NC_009348	CAA	2	6	2538	2543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297126
56	NC_009348	GAA	2	6	2554	2559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297126
57	NC_009348	GCT	2	6	2568	2573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297126
58	NC_009348	CAG	2	6	2688	2693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297126
59	NC_009348	ATT	2	6	2698	2703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145297126
60	NC_009348	ATC	2	6	2714	2719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297126
61	NC_009348	GTG	2	6	2734	2739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297126
62	NC_009348	CAG	2	6	2802	2807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297127
63	NC_009348	CGGG	2	8	2930	2937	0 %	0 %	75 %	25 %	145297127
64	NC_009348	GCCCAG	2	12	3057	3068	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145297127
65	NC_009348	ATCC	2	8	3108	3115	25 %	25 %	0 %	50 %	145297127
66	NC_009348	CTG	2	6	3129	3134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297127
67	NC_009348	G	7	7	3137	3143	0 %	0 %	100 %	0 %	145297127
68	NC_009348	CTGG	2	8	3161	3168	0 %	25 %	50 %	25 %	145297127
69	NC_009348	GCG	2	6	3221	3226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297127
70	NC_009348	C	6	6	3442	3447	0 %	0 %	0 %	100 %	145297127
71	NC_009348	GTT	2	6	3584	3589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297127
72	NC_009348	AGC	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297127
73	NC_009348	T	7	7	3652	3658	0 %	100 %	0 %	0 %	145297127
74	NC_009348	ATG	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297127
75	NC_009348	GTT	2	6	3800	3805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297127
76	NC_009348	AG	3	6	3848	3853	50 %	0 %	50 %	0 %	145297127
77	NC_009348	CTC	2	6	3880	3885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145297128
78	NC_009348	GAT	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297128
79	NC_009348	CAC	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297128
80	NC_009348	GTC	2	6	3989	3994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297128
81	NC_009348	CGTG	2	8	4072	4079	0 %	25 %	50 %	25 %	145297128
82	NC_009348	GAG	3	9	4112	4120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145297128
83	NC_009348	CCG	2	6	4128	4133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297128
84	NC_009348	TCA	2	6	4140	4145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297128
85	NC_009348	TGC	2	6	4152	4157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297128
86	NC_009348	CGG	2	6	4162	4167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297128
87	NC_009348	GGC	2	6	4199	4204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297128
88	NC_009348	GTT	2	6	4226	4231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297128
89	NC_009348	CT	3	6	4238	4243	0 %	50 %	0 %	50 %	145297128
90	NC_009348	CGC	2	6	4265	4270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297128
91	NC_009348	CAG	3	9	4339	4347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297128
92	NC_009348	TCCT	2	8	4445	4452	0 %	50 %	0 %	50 %	145297128
93	NC_009348	CGTT	2	8	4533	4540	0 %	50 %	25 %	25 %	145297128
94	NC_009348	ATCC	2	8	4568	4575	25 %	25 %	0 %	50 %	145297128
95	NC_009348	CAA	2	6	4672	4677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297128
96	NC_009348	TGG	2	6	4707	4712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297128
97	NC_009348	AAG	2	6	4772	4777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297128
98	NC_009348	GCC	2	6	4787	4792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297128
99	NC_009348	GCG	2	6	4794	4799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297128
100	NC_009348	TCC	2	6	4859	4864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145297128
101	NC_009348	CCG	2	6	4902	4907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297128
102	NC_009348	CTG	2	6	4943	4948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297128
103	NC_009348	CAA	2	6	4978	4983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297128
104	NC_009348	ATC	2	6	4985	4990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297128
105	NC_009348	GCCCGT	2	12	4997	5008	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145297128
106	NC_009348	CGC	2	6	5039	5044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297128
107	NC_009348	CTG	2	6	5142	5147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297128
108	NC_009348	GAA	2	6	5176	5181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297128
109	NC_009348	GAT	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297128
110	NC_009348	CTC	2	6	5248	5253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145297128
111	NC_009348	CAT	4	12	5338	5349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297128
112	NC_009348	CTT	2	6	5398	5403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145297128
113	NC_009348	ATC	2	6	5423	5428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297128
114	NC_009348	CTACAT	2	12	5437	5448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297128
115	NC_009348	GCC	2	6	5455	5460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297128
116	NC_009348	AAG	2	6	5474	5479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297128
117	NC_009348	GCT	2	6	5515	5520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297128
118	NC_009348	CGG	2	6	5587	5592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297128
119	NC_009348	CCG	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297128
120	NC_009348	CTG	2	6	5717	5722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297128
121	NC_009348	CTG	2	6	5738	5743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297128
122	NC_009348	CGT	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297128
123	NC_009348	CGT	2	6	5851	5856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297128
124	NC_009348	TCC	2	6	5909	5914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145297128
125	NC_009348	GGT	2	6	5969	5974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297128
126	NC_009348	TCA	2	6	5976	5981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297128
127	NC_009348	ACC	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297128
128	NC_009348	TGC	2	6	6144	6149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297128
129	NC_009348	CGA	2	6	6160	6165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297128
130	NC_009348	TCG	2	6	6220	6225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297128
131	NC_009348	T	6	6	6317	6322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009348	ATG	2	6	6358	6363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297129
133	NC_009348	CGG	2	6	6467	6472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297129
134	NC_009348	GATT	2	8	6485	6492	25 %	50 %	25 %	0 %	145297129
135	NC_009348	CTT	2	6	6608	6613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145297129
136	NC_009348	CAG	2	6	6642	6647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297129
137	NC_009348	GAC	2	6	6711	6716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297129
138	NC_009348	CTG	2	6	6788	6793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297129
139	NC_009348	GGT	2	6	6855	6860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297129
140	NC_009348	GAT	2	6	6861	6866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297129
141	NC_009348	ACC	2	6	6868	6873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297129
142	NC_009348	TGAT	2	8	6874	6881	25 %	50 %	25 %	0 %	145297129
143	NC_009348	GTT	2	6	7031	7036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297129
144	NC_009348	GAT	2	6	7133	7138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009348	GCA	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009348	GAT	2	6	7208	7213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009348	TTGG	2	8	7395	7402	0 %	50 %	50 %	0 %	145297130
148	NC_009348	CGG	2	6	7513	7518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297130
149	NC_009348	CGAACA	2	12	7564	7575	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145297130
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151	NC_009348	AAC	2	6	7683	7688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297130
152	NC_009348	TGG	2	6	7708	7713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009348	CTG	2	6	7752	7757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_009348	CTG	2	6	7794	7799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297131
155	NC_009348	CAG	2	6	7818	7823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297131
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157	NC_009348	GCGAT	2	10	7870	7879	20 %	20 %	40 %	20 %	145297131
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164	NC_009348	TCA	2	6	8185	8190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297131
165	NC_009348	CGA	2	6	8198	8203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297131
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167	NC_009348	GCTG	2	8	8375	8382	0 %	25 %	50 %	25 %	145297131
168	NC_009348	CATGG	2	10	8460	8469	20 %	20 %	40 %	20 %	145297131
169	NC_009348	TAT	2	6	8544	8549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_009348	AGA	2	6	8554	8559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_009348	TA	3	6	8640	8645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_009348	AGG	2	6	8698	8703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_009348	AAT	2	6	8707	8712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_009348	GCAATG	2	12	8823	8834	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145297132
175	NC_009348	C	6	6	8843	8848	0 %	0 %	0 %	100 %	145297132
176	NC_009348	ACA	2	6	8850	8855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297132
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178	NC_009348	TGGC	2	8	8898	8905	0 %	25 %	50 %	25 %	145297132
179	NC_009348	GCA	2	6	8961	8966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297132
180	NC_009348	GCAG	2	8	8968	8975	25 %	0 %	50 %	25 %	145297132
181	NC_009348	CGT	2	6	9026	9031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297132
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183	NC_009348	TTA	2	6	9229	9234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_009348	AGGAT	2	10	9237	9246	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
185	NC_009348	AGC	3	9	9337	9345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297133
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187	NC_009348	AGCTGG	2	12	9426	9437	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145297133
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189	NC_009348	ACA	2	6	9705	9710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_009348	TGT	2	6	9733	9738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
191	NC_009348	CTG	2	6	9766	9771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_009348	GTTC	2	8	9805	9812	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
193	NC_009348	CAA	2	6	9868	9873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
194	NC_009348	GCA	2	6	9945	9950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_009348	TGA	2	6	10029	10034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_009348	TGC	3	9	10151	10159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_009348	GGTTG	2	10	10184	10193	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
199	NC_009348	GAG	2	6	10247	10252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
200	NC_009348	TTG	2	6	10256	10261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_009348	CAG	2	6	10493	10498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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210	NC_009348	A	6	6	10724	10729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
211	NC_009348	TGC	2	6	10741	10746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
212	NC_009348	GGGT	2	8	10752	10759	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
213	NC_009348	CTG	2	6	10769	10774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
214	NC_009348	CGATA	2	10	10786	10795	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
215	NC_009348	TGC	2	6	10842	10847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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217	NC_009348	GGC	2	6	10868	10873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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232	NC_009348	T	6	6	11391	11396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_009348	A	6	6	12792	12797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_009348	ATG	2	6	12828	12833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_009348	AAG	2	6	12860	12865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_009348	T	6	6	12897	12902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_009348	CAG	3	9	13079	13087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297136
262	NC_009348	TGG	3	9	13152	13160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297136
263	NC_009348	AGCT	2	8	13162	13169	25 %	25 %	25 %	25 %	145297136
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265	NC_009348	GAA	2	6	13233	13238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_009348	GCT	2	6	18969	18974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297139
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399	NC_009348	CTT	2	6	19231	19236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145297139
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449	NC_009348	CGT	2	6	21536	21541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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